Unser Logo besteht aus einem großen "G" als Anfangsbuchstaben des Namens der Heiligen Gertrud, unserer Namenspatronin. Vom "Boden" des G sprießen vier Triebe nach oben, über den oberen Rand des G hinaus. Diese stehen zunächst einmal für die vier Gründungsklöster unserer Kongregation (St. Marienthal, St. Marienstern, Kloster Langwaden und Kloster St. Marien zu Helfta). Aber sie symbolisieren gleichzeitig auch den neuen Aufbruch, die darin liegende Hoffnung und den Verweis auf eine Zukunft, die auf dem Nährboden unserer großen Vergangenheit gedeihen soll. Dieser Boden wurde auch von den vier großen Mystikerinnen des Klosters Helfta bereitet, zu denen neben der Hl. Gertrud der Großen (= Gertrud von Helfta) auch Mechthild von Hackeborn, deren leibliche Schwester Gertrud von Hackeborn sowie Mechthild von Magdeburg zählen.
Neben dem Logo befindet sich der Schriftzug "Zisterzienserkongregation von der heiligen Gertrud der Großen" als vollständige Bezeichnung.